L'île Daphné est une petite île inhabitée située à environ 18 miles (29 km) au nord-ouest de l'île de Baltra. Cette île est célèbre pour ses paysages spectaculaires, ses colonies d'oiseaux marins et ses nombreuses espèces endémiques. L'île Daphné est en fait divisée en deux parties: Daphné Major et Daphné Mineur. Daphné Major est la plus grande des deux et mesure environ 1,4 km de long. Elle a une forme presque circulaire et culmine à environ 120 mètres d'altitude. L'île est un lieu important pour l'étude scientifique des oiseaux marins. Plusieurs espèces y ont établi des colonies, notamment les frégates, les fous à pattes bleues et les fous masqués. Les visiteurs peuvent observer ces oiseaux depuis les bateaux de tourisme qui naviguent autour de l'île, mais il n'est pas possible de débarquer sur l'île elle-même. L'île Daphné est également un site important pour l'étude de l'évolution. En 1977, le biologiste Peter et Rosemary Grant ont commencé une étude à long terme des becs de pinsons des Galapagos sur l'île Daphné Major, qui a fourni des preuves importantes pour la théorie de l'évolution de Darwin. Cette étude est toujours en cours et les scientifiques continuent d'étudier l'impact du changement climatique sur les populations de pinsons des Galapagos.